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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

四川：对各种大呼隆的论坛等活动进行清理整顿******

　　中新网成都1月11日电 (记者 王鹏)四川省十四届人大一次会议11日上午在成都开幕，四川省人民政府省长黄强向大会作政府工作报告。报告指出，四川要切实加强政府自身建设，着力提高政府现代化治理能力，努力建设人民满意的政府。

　　报告指出，要牢记“空谈误国、实干兴邦”。坚持行胜于言，讲真话、讲实话、讲短话、讲对群众有用的话，不看唱功看做功。坚持务实功、办实事、求实效，每年盯住和干成几件像样的大事，不搞那些看起来热闹、实际没有效果的表面文章，对各种大呼隆的论坛等活动进行清理整顿。坚持调研先行，深入基层了解实情，“少看花瓶和盆景，多看后院和角落”。持续整治不作为、乱作为、假作为现象，让干部敢为、地方敢闯、企业敢干、群众敢首创蔚然成风。

　　增强推动高质量发展本领方面，报告提出，要善于抢抓机遇，担当中央赋予四川重任，干成塑造格局、奠基长远的大事。善于转化优势，把国家重大战略与本地情况更好地结合起来，找到符合地方特色的高质量发展路子。善于守正创新，克服思维惯性和路径依赖，用改革的办法、开放的手段破解难题，激发市场活力和发展内生动力。善于统筹兼顾，坚持系统观念，把握实践标准，不断提高在复杂环境、多重约束下解决现实问题能力。建立全省经济发展责任体系，倒逼高质量发展。

　　报告指出，要坚持人民至上、依靠人民。真心实意为人民而干，真正办好老百姓急难愁盼的事，未来五年的民生大事要办得更实更具体。坚持政府过紧日子，严肃财经纪律，严控“三公”经费，严管“跑冒滴漏”，压减一般性支出，推进节约型机关建设。把人民满意作为衡量政府工作的标尺，回应人民关切，尊重人民创造，集中人民智慧，齐心协力推动四川各项事业发展。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）